Anthology incluiu várias alterações para os jogos, os mais notáveis sendo as aberturas e encerramentos em CGI. Além disso, Final Fantasy VI incluiu bônus, que consistia das seguintes características: Teatro conematográfico Artes conceituais Bestiário Guia do Dragon's Neck Colosseum Lista de Esper Lista das Lores de Strago A maior parte dos recursos exigem que o jogador vença o jogo uma vez antes de vê-las, mas o Teatro Cinematográfico, Artes Conceituais e Bestiário podem ser acessado desde o início, embora apenas metade dos recursos do referido categorias podem ser acessados ??nesse ponto. Além disso, Squall Leonhart, ocasionalmente, faz uma aparição na tela título de Final Fantasy VI.